Funkční magnetická rezonance nebo-li fMRI z anglického functional magnetic resonance imaging, což by se dalo přeložit jako funkční zobrazování magnetickou rezonancí, je technika, která ukazuje, které části mozku jsou aktivní. Je založena na detekci změn průtoku krve a množství kyslíku spotřebovaného v různých oblastech mozku. Oblasti, které jsou aktivní, spotřebovávají více kyslíku a mají větší požadavky na průtok krve.

Silné magnetické pole a elektromagnetické vlnění s vysokou frekvencí donutí částice uvnitř atomů v mozku chovat se určitým způsobem, kterým je vytvářen slabý signál. Tento signál je různý pro různé druhy atomů. Snímá se buď z atomů vodíku obsažených ve vodě resp. v krvi, nebo z atomů kyslíku, který je díky hemoglobinu také vázán v krvi. Signál se v různých částech mozku liší, takže části s větším prokrvením se ve výsledku projevují jiným barevným odstínem než části ostatní.

Více o technikách funkčního zobrazování mozku naleznete na níže uvedených odkazech.